Pues de cada 10 veces, debería funcionarte 10. La tienes que poner antes de guardar el fichero.
Si no te funciona, creo que no vas a poder conseguir lo que pretendes, pues desde el momento en el que se presenta en pantalla el formulario para responder Si/No, lo que se pretende es que el usuario interactúe con el mismo. No creo que se pueda automatizar una respuesta, pues ya no es el macro quien tiene el control, sino que es el cliente quien debe responder, y el macro seguirá actuando en función de la respuesta.
Prueba este macro en un libro nuevo:
Código:
Sub Macro1()
Application.DisplayAlerts = False
Range("A1").Select
ActiveCell = "Prueba"
ActiveWorkbook.SaveAs Filename:="C:\Mis documentos\ejemplillo.xls"
End Sub
Salu2