Código SQL:
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SET @SQL='select count(*) RegistrosNA from mustXproy mp inner join mustCerebro mc on mp.idmust =mc.id where idproy='+CONVERT(VARCHAR(5),@idProyecto) + ' and etapa in ('+@etapas+') and guardaProy=''NA'''
sobre todo esta parte que es lo que hace agradesco sus comentarios!!
where idproy='+convert(varchar(5),@idProyecto) +