Pero desde ayer me di cuenta que el proceso "mysqld.exe" esta ocupando el 100% de la cpu, ocacionando que la pagina sea innavegable, debido a que se cuelga

Probe reinstalando el mysql server, pero siguió igual, recuerdo que este proceso no ocupaba tanto. hay algo que pueda acer, o como puedo saber que pasa.
Gracias por su ayuda
PD: la version de mysql es la 5.1, y lo tengo en un servidor dedicado "windows server 2008 standar"
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Acabo de encontrar que la causa es que habían muchas conexiones a la base de datos, que no se estaban ejecutando... así que las elimine, y ya el proceso volvió al 0% ^_^, sin embargo, si alguien hace un pequeña consulta se dispara nuevamente hasta el 25, 50 o 75% O.o