No.
No se puede
alterar un procedimiento en el sentido del uso del ALTER en las tablas, por ejemplo, porque no se trata de una estructura de base sino de un script de sentencias y MySQL no podría saber a qué parte del script haces referencia.
Por eso los SP no se editan con un ALTER, sino que se vuelven a cargar completamente. Eso se hace eliminándolos primero:
Y luego se vuelven a cargar:
Esto mismo se hace con los STORED FUNCTIONS y TRIGGERS.
Para
modificar un SP te conviene usar un Front-End como MySQL Workbench o algún otro de características similares.