Estoy suponiendo que usas XP.
Tienes que abrir el menú de inicio de windows, luego te metes en los programas, y por ahí debe aparecerte una carpeta llamada Inicio, dentro de ella suele instalar un acceso directo a un .exe que es el troyano. Eliminas ambos.
Como te decía no recuerdo si era exactamente esa la manera de quitarlo, pero si no es exactamente así es muy parecido. Lo bueno es que no tienes que usar antivirus u otro tipo de programas.
También puedes ejecutar la herramienta msconfig (inicio -> ejecutar, y escribes msconfig) y dentro de él en la pestaña "Inicio" buscar a ver si se ha metido ahí.
Si quieres muevo este hilo al foro de virus y troyanos donde quizá te asesoren mejor...
Saludos