No, no puedes hacer que se indexe ni posicionar los contenidos de la base de datos.
Flash funciona como una caja negra, te indexa el SWF y listo.
Y como no puede conocer los enlaces internos, y mucho menos ejecutar consultas, no va a conocer el resto del contenido.
En cuanto a las etiquetas se refiere es a HTML.
El Flash no se puede posicionar, lo que puedes posicionar es el HTML que contiene el Flash.
Te dejo un artículo que resulto luego de hablar este tema hace un tiempo acá en el foro:
Pescando SEO con Flash
Incluso ahí hay varias soluciones, alternativas, para posicionar el HTML que contiene el Flash, ya que Flash no se posiciona. Es de hace un un tiempo pero no ha mejorado en nada hasta ahora.