Cuando uno entra con el ".com", el servidor lo que hace es armar un frame para mostrar los contenidos del ".es". Consecuentemente, siempre que se navegue la web desde el .com la url quedará apuntando al index, por más que en el frame la pagina cambie.
Lo pueden ver aqui:
punto com
punto es
Que se puede hacer para que al navegar desde el .com cambie la url? No es bueno que quede estática porque así no se puede compartir enlaces. Ademas es confuso. Y encima el cliente quiere mucho al .com

Se podrá hacer algo con una directiva del .htaccess, o habrá alguna manera de tomar la url del iframe y ponerla en el navegador? Si no lo ven como tema de Apache, por favor muevan este hilo. Gracias!