Evitar rewrite en carpeta de administracion

[n0ldor]

Hola buenos días, la cuestión es que tengo una web en la que todos los enlaces apuntan a un .php que no existe y mediante el htaccess lo redirecciono todo al index.php que es el que se encarga de cargar lo que correspando dependiendo de la URL. Para ello utilizo lo siguiente:

Código:

<IfModule mod_rewrite.c>
    RewriteEngine On
    RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
    RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
    RewriteRule ^(.*)$ /index.php/$1 [L]
</IfModule>

Hasta este punto todo me funciona correctamente, solo que ahora lo que quiero es hacer lo mismo para la administración, pero el problema que tengo es que la administración está en una carpeta llamada "admin" dentro del mismo servidor, por lo que el htaccess de la web me redirecciona al index de la web.
¿Como podría hacer para que dentro de la carpeta admin utilice otro htaccess distinto que se encargue de hacer lo mismo saltandose el htaccess del raiz?
¿Me recomendais alguna otra manera para hacerlo?

Un saludo