Tiempo máximo de ejecucion de un script.

[Calisco]

Hola. Tengo un problema en un servidor en el cual estoy implementando un script para subir archivos con una barra de progreso.
Como se sabe .. php solamente no se puede. Entonces estoy subeindo el archivo mediante un script .cgi y funciona bastante bien.
http://yomiento.webfactional.com/lig...oad_tester.php

Mi problema es que este servidor tiene definido un tiempo máximo de 2 minutos cuando se ejecuta un script; si el script supera este tiempo apache lo corta de cuajo.

Para los scripts en php pude modificar estos datos mediante el .htaccess

Código PHP:

  <IfModule php5_module>
   php_value upload_max_filesize 100M
   php_value max_execution_time 36000
   php_value max_input_time 36000
</IfModule> 
   

Existe alguna forma de modificar el tiempo de ejecución para un script .cgi mediante un archivo .htaccess o cualquier otra manera ?.
Es un servidor 'dedicado'; pero no creo que pueda tocar archivos como por ejemplo httpd.conf de apache.
La verdad que estoy del coco.
Saludos y muchas gracias desde ya.