a mi me paso algo similar, daba de alta subdominios y no funcionaban y la solucion fu sencilla pero me costo dar con ella ya que era la primera vez que me meia en el mundo este de los servidores web, yo trabajo con amen y te cuento conforme se trabaja con ellos, tu lo tendras que adaptar a tu sistema pero aunque la practica cambie la teoria es la misma
tengo un servidor con un virtualhosting y "x" dominios dados de alta que apuntan al servidor, los dominios fincionaban perfectamente pero los subdominios nada de nada
si en la pagina de amen accedo al dominio que tengo dado de alta, en las opciones de dicho dominio hay una que se llama zona dns en la que hay como una lista de redirecciones, mail, webmail,
www... pues solo tuve que añadir una nueva con el nombre del subdominio y de tipo A que apuntase a la ip del servior y listo.
Cuando lo hagas tal vez lo pruebes y seguira sin funiconar, esto puede tardar hasta 48 horas en completarse asi que... paciencia y mucha suerte