Las diferencias entre uno y otro son bastante técnicas, hasta hace un tiempo el problema de php sobre IIS era estabilidad vs velocidad, pero se han incorporado muchas mejoras. Hoy lo ideal es usar PHP NonThreadSafe instalado como FastCgi.
Deberías bajarte la
VC9 x86 Non Thread Safe (2011-Aug-23 12:26:18) ,que requiere
Microsoft 2008 C++ Runtime (x86) ó Microsoft 2008 C++ Runtime (x64)
con respecto a las instalaión, te dejo un par de guias
http://learn.iis.net/page.aspx/247/u...ons-on-iis-60/ http://phplens.com/phpeverywhere/fastcgi-php
y la de microsoft
http://technet.microsoft.com/es-es/l...30(WS.10).aspx
pero que es aplicable a IIS7 , no sé si sirve para el 6
Saludos