Proteger carpetas en VPS

[ioscar]

Estoy analizando mi web en http://www.woorank.com y me mostro estos mensajes que me preocuparon :

Acceso a los Directorios Si
Bajo impacto
Fácil de arreglar

Cuidado! Sus servidores autorizan el acceso a sus ficheros. Es un fallo de seguridad y un hacker podria facilmente dañar o copiar su página Web.

Firma del Servidor Si
Bajo impacto
Fácil de arreglar

Cuidado: la firma de sus servidores esta activada y está dejando información que podría ser usada por los hackers.

Sobre el primer problema encontre esto : proteger

Pero no se ke carpetas debo proteger en mi VPS ,

Y que tengo que hacer con la firma del servidor ?

[hombreman]

Esto

Código htaccess:

ServerSignature Off 
Options -Indexes
 

[ioscar]

@hombreman entonces coloco ese .htacces en la raiz de mi pagina web para quitar la firma del sitio

Y doy por hecho que en la parte de proteger las carpetas me baso en el archivo que mencione arriba , pero sigo con esta duda :

mi proyecto esta asi /var/miproyecto/carproteger

protejo la carpeta carproteger , mi duda era si tenia que hacer lo mismo con las carpetas bin , etc , usr ..... para evitarme problemas

[hombreman]

Esas carpetas no son accesibles desde httpd...

... obvio en una configuración decente.