Ejecutar aplicacion en servidor

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Hola a todos, lo que estoy intentando hacer, y aun no tengo un camino de como hacerlo es una aplicacion en la que podamos ejecutar un programa que se encuentra instalado en el servidor pero con unos archivos que propios del usuario, que en un principio no deberia porque tener que subirlos(esta es la idea inicial, no creo que se pueda hacer sin subirlos), o que tenga que subirlos a nuestro servidor pero de una manera "limpia" o camuflada. ¿Como me aconsejais hacerlo? ya que me encuentro un poco perdido en estos momentos.

un saludo y gracias

[David]

No se puede. Y de hecho creo que a ningún usuario le gustaría que su navegador permitiese a cualquier sitio acceder a sus archivos.

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Y como me recomendariais hacer esto?
Yo tengo una apicacion que he desarrollado para linux, Esa aplicacion para que funcione necesita unos archivos que me pasa el usuario, yo ejecuto esa aplicación y le devuelvo al usuario el resultado. El problema viene con esos archivos del usuario, que puede ser que el usuario no quiera que terceras personas tengan acceso a ellos (yo tampoco les quiero para nada), pero hay que darle al usuario esa confianza de que esos archivos van a estar seguros al subirlos y ejecutarlos con nuestro programa (que posteriormente les vamos a borrar, o que no les vamos a almacenar)¿Como podria lograr eso?¿Que recomendacion me dariais?

un saludo y muchas gracias

[eMaa]

Porque no tomas los archivos desde un form? y despues trabajas con eso

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porque no se el numero de archivos y ademas estos podrian tener jerarquia, es algo que ya habia pensado, pero ademas de eso tengo el problema de con ese metodo como logro que el usuario se crea que no me quedo con los archivos??(ya se que esto ultimo es algo que posiblemente no se pueda lograr...) Otra opcion que habia barajado es con un VNC multisesion ¿COmo lo veis?¿Cual me recomendariais?

un saludo y muchas gracias por las respuestas

[David]

Si el usuario te entrega los archivos (que es la única forma en que puedas trabajar directamente con esos archivos) no hay como asegurarle que no los almacenas. Lo que deberías hacer es especificarlo claramente en la Política de Privacidad.