No se puede alfil_negro, ya que el mos_config_live_site requiere de un solo dominio. Lo que sí puedes hacer es tu propio pack comprimido de Joomla y tenerlo guardado en un directorio. Cuando quieras asignar el pack a un nuevo dominio sólo será necesario descomprimirlo en la ruta correcta y listo (Debes tener acceso shell para hacer eso). Si tienes un dedicado, quizás quieras incluir Joomla en tu Fantastico y así permitir que tus nuevos usuarios lo instalen con un click desde su panel de hosting.
Si cuentas con un server compartido sólo con acceso a tu Cpanel, te recomiendo ampliamente
b2evolution, el cual te permite crear múltiples páginas para los usuarios que desees. Ellos tendrán su propio panel de administración (Del blog) y pueden hacer distintas funciones, incluyendo la de escoger su propia plantilla. Lo mejor de todo es que no tienen que instalar nada, y a la hora de una actualización sólo tendrías que hacerla 1 sola vez, en lugar de tantas veces como sitios existan. En cuanto al dominio tienes la opción del subdominio (subdominio.tusitio.com), y si es muy necesario el dominio puedes arreglarlo con una redirección.
Personalmente te recomiendo ampliamente esta última alternativa. Para lo que necesitas b2evolution te caerá de perlas.
Saludos.