Pues eso, algunos IDEs como el JBuilder en la pestaña "Design" si haces click derecho hay opciones de "move to last/first" que sirven para poner unos componentes debajo o encima de otros...
Pero el tema es que me gustaría saber cómo se hace por código...
Un saludo
Ej:
Poner un boton encima de una label
Edito: Solucionado