He logrado hacerlo, pero de forma individual.
Código:
Pero lo que quiero es que se muestren todos los elementos guardados dentro del arreglo en una sola ventana en forma de lista.JOptionPane.showMessageDialog(null, "Estudiante: " +estudiante[1][i]+"\nMatricula: " +estudiante[0][i]);
Espero puedan ayudarme. Gracias.