duda como definir base de datos en una aplicación web

[gioropu]

Hola, tengo que realizar un aplicación web de gestión de contenido de base de datos. Las herramientas a utilizar: MySQl, JSP y tomcat. Ahora bien, mi profesor me ha dicho que al realizar una aplicación web tengo incluir la definición de la base de datos, pero no me ha dado ninguna otra explicación y estoy estancado con ello. ¿Alguién sabe por donde va los tiros para incluir la definición de la base de datos en la aplicacion web?