Hola pereztroff, algunos programas limpiadores de registro tienen la opcion de grabar un backup antes de limpiar el registro, busca esta opcion en tu programa y recuperalo, aunq para la proxima el mas recomendable es el Regseeker, si esto no funciona tienes varias opciones:
1. Debes reiniciar tu maquina y presionar F8 hasta q te salga un menu de opciones, elige la opcion Reiniciar desde la ultima configuracion buena conocida, con esto se podra recuperar el sistema operativo.
2. Arranca con un Disco de Inicio y en el prompt
C:\> escribe
scanreg/restore elige la fecha en la q limpiaste el registro.
3. Repara el sistema operativo, ingresa a la BIOS y ordena tu secuencia de arranq para q inicie desde el CD, sal de la BIOS guardando los cambios, inserta el CD del sistema operativo y una vez cargado los drivers y demas hierbas, busca la opcion de
Reparar.
Una de la opciones te puede solucionar el problema, espero haberte ayudado, suerte