Es raro que no podas comunicarte de XP a 9x. Es simplemente tener el mismo grupo de trabajo y crear los mismos usuarios del 9x al XP. Con solo eso podrías compartir y comunicarte perfectamente. Además, hay muchos temas sobre eso en el foro, te recomiendo usar la opción de búsqueda (lo vas a ver al inicio de este mensaje).
Sobre cómo volver a 9x, no podrías usar el FDISK ya que tenes 2 particiones y ambas son NTFS, la razón es que el FDISK te va a reconocer la partición primaria como NO DOS y podrías borrarla pero la segunda partición la detectaría como una extendida y al querer ver la unida lógica no te lo va a permitir...
En resumidas cuentas y para no complicarte, la forma de volverte a 9x es introduciendo el CD de XP o 2000, realizar el proceso de instalación normal (iniciando desde el CD), le indicas que vas a hacer una instalación nueva y cuando llegues a la sección donde está tu HD (Disco Duro), eliminas TODAS las particiones, luego creas una de 5 gigas, luego le indicas que instale y cuando te diga el formato de archivos a usar, le indicas FAT32. Apenas termine de formatear y empiece a copiar los archivos del sistema, apagas el equipo y ahora si podrías usar el FDISK.
Ahora, antes de explicarte todo ese proceso, te dejo esta referencia de
Preguntas frecuentes Windows en los foros, busca donde dice FDISK. Ahi hay varios artículos donde te explican todo paso a paso.