Intenta iniciando desde un diskette de wintendo 98. Si no lo tenes, podes conseguirlo de
BootDisk.
Cuando te presente el menú, indicale que vas a iniciar e modo DOS con soporte a CD-ROM y te fijas la letra que le asigna.
No se si sabes DOS, por lo que te voy a poner los comandos paso a paso:
D: <ENTER>
MD WIN98 <ENTER>
CD WIN98 <ENTER> (Esto para que este dentro del directorio aunque te cambies de unidad)
Luego te pasas a la unidad de CD-ROM
<letra de la unidad del CD-ROM con wintendo> ejemplo H: <ENTER>
CD WIN98 <ENTER>
COPY *.* D: <ENTER>
Con este paso, te va a copiar todo a D y a al directorio que creaste.
Concluido con eso, te pasas a D: <ENTER> y ahi ejecutas el archivo que dice INSTALAR o SETUP (si es en inglés) y cuando te diga el directorio a instalar C:\WINDOWS, le cambias la C: por D: para que quede D:\WINDOWS.
Todo lo anterior lo podes hacer siempre y cuando el HD este bien particionado y formateado.