Lilo debe de estar instalado en el MBR del disco duro maestro (hda), para incluir windows en el arranque, pones en /etc/lilo.conf:
   Código PHP:
    boot=/dev/hda            # Instalar LILO en el MBR
prompt                     # Darle al usuario una oportunidad de seleccionar otra opción
timeout=50                # Esperar 5 (cinco) segundos antes de arrancar la opción por defecto
default=Linux          # Al transcurrir el plazo de espera, arrancar la opción "Linux"  
# Solamente si usa un framebuffer. De otra manera elimine la siguiente línea:
vga=788                   # Configuración de framebuffer. Ajústela según su configuración
 
# Linux
image=/boot/vmlinuz # escribes la ubicación del nucleo 
 label=Linux         # El nombre de la sección
 read-only               # Comience con la raíz solo lectura. ¡No modifique!
  root=/dev/xxxx          # Ubicación del sistema raíz de archivos
 
#Para Windows
 
other=/dev/xxxx
  label=windows 
    
  Ya despues grabas y escribes:  
 Código PHP:
    lilo
o
/sbin/lilo 
    
  No estoy muy seguro si todavia exista "liloconfig"