Código asi:
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configurar proxy ubuntu 9.04: System->Administration->Synaptic Package Manager luego seleccionar Settings->Preferences->Network y ahi agregar su direccion proxy y el puerto si ocupamos usuario y password, darle click a autenticacion, y agregar los campos correspondientes para configurar apt-get: abrimos la consola, y tecleamos: cd /etc/ ya en la carpeta, la damos un sudo gedit profile y agregamos al final las siguientes lineas: http_proxy=http://usuario:pass@nombreProxy:puerto export http_proxy/
le damos guardar al archivo, y reiniciamos el sistema, y ya con ese empezara a funcionar. Ya lo cale yo y todo funciono perfecto.