Podrías concretar un poco más tu pregunta? Creo que lo que estás haciendo es instalar Linux en un equipo que ya tiene instalado Windows, el asistente de instalación te pregunta si quieres instalar un gestor de arranque, y no sabes qué hacer. Si ése es tu problema, te diré que en principio sí que es necesario instalar un gestor de arranque (suele tratarse de LILO o GRUB), generalmente en el MBR (Master Boot Record), para que al arrancar el ordenata te pregunte si quieres ejecutar Windows o GNU/Linux (si no instalas un gestor de arranque ejecutará directamente Windows). De todos modos, tampoco es imprescindible, siempre que tomes la precaución de crear un diskette de arranque durante la instalación.
Si no era ésa tu pregunta, vuelve a formularla de una manera más detallada.