Pues vamos que es cierto lo que dicen muchos, el xhtml de transición hace rato que debió ser dejado de lado, pero como aún existen etiquetas que se usan es difícil dejarlo, y bien, de todas maneras es probable que dure aún lo que va a durar el ie6, mi opinión es clara y es dejarlo de lado.
Quizá por un par de cosas que se dejen de lado no vayamos a morirnos.
Saludos!