Puedes hacerla en flash o en una imagen, y con javascript la colocas en donde quieres dentro de otra ventana, como hace netscape en su página de inicio
http://home.netscape.com/
Pero una ventana nueva e independiente no se si le puedes hacer un nuevo botón de cerrar, lo que puedes hacer es abrir un window.open(...fullscreen...) y ahí tienes toda la ventana para diseñar tu página, y puedes inventarte un botón de cerrado....pero siempre ocupara el 100% de la ventana....
Son las únicas maneras que se me ocurren...
Saludos