Les anexo código para habilitar o deshabilitar los checkbox de un jalon
<script language="JavaScript" >
/////Función para habilitar ó desabilitar de jalón todos los checkbox
function SeleccionCheckbox(forma, opcion) {
var i,opcion;
for (i=0;i<=forma.elements.length-1;i++)
{
if (forma.elements[i].type=="checkbox"){
if (opcion==1) forma.elements[i].checked=true;
else if (opcion==0) forma.elements[i].checked=false;
}/*del if */
} /* del for*/
}/* de la función */
</script>
</head>
<body>
<form name="miFormulario" >
<input type="checkbox" name="miCheck1">
<input type="checkbox" name="miCheck2">
<input type="checkbox" name="miCheck3">
<br>
<input type="button" value="Habilita todos" onClick="return SeleccionCheckbox(this.form,1)">
<input type="button" value="Deshabilitar todos" onClick="return SeleccionCheckbox(this.form,0)">
</form>
Saludos!