Lo ideal es instalar primero el 98, luego el XP, ya que el XP dispone de una opcion automatica que detecta si hay mas de un OS instalado y te muestra un menú.
Mi consejo es que hagas copias y instales todo de cero, te evitarás problemas, creeme.
Yo tengo instalados los dos pq con XP hay programas que no me funcionan, además siempre me queda iuno de respaldo si algo anda mal... como ocurre a menudo
Si quieres que se vean todos los discos si arrancas con el 98 solo tienes que formatear todas las particiones o discos para FAT32, recuerda que el XP está basado en NT y el formato de archivos NTFS no es soportado con 9x, de todos modos los basados en NT como el XP si reconoce los dos formatos.
Saludos