Si te refieres a DB diferentes dentro del mismo servidor (o en otro) lo usas con los "fully cualified names"
Código:
--En diferentes servidores
SELECT * FROM
servidorA.basedatos1.dueño.tabla AS tabla1
INNER JOIN
servidorB.basedatos2.dueño.tabla AS tabla2
ON ....
--En el mismo servidor
SELECT * FROM
basedatos1.dueño.tabla AS tabla1
INNER JOIN
basedatos2.dueño.tabla AS tabla2
ON ....