Eso de teclear con el root solo es para sistemas operativos con Linux o Unix. lo que me da a entender es que el libro esta orientado a estos S.O., pero no te preocupes PHP y MySQL solo difieren un poco con Windows referentes a los comandos; lo que cambia es la intalacion y otras cositas.
Si quieres entrar a modo comando en MySQL tienes que entrar en un prompt de CMD o DOS. Luego entra donde instalastes ySQL me imagino que en
C:\MySQL . Una vez adentro entra al subfolder
\BIN y teclea
mysql.exe (antes de hacer todo esto el servicio de MySQL debe de estar corriendo); te dara un mensaje de
BIENVENIDA y si tecleas
HELP apareceran los comandos que puedes utilizar.
Me imagino que en tu libro estan algunos de estos comandos (al menos la mayoria) lo que pasa tambien es que en Linux o Unix aparecen mas pero tienes los basicos y fundamentales para empezar.
Saludos.