FTP y windows server 2008 R2, transferencia incompleta de datos

[aviateco]

Estimados, quiero consultarles sobre un problema que actualmente ya tope, y no he podido resolver, lo que sucede es que existía un servidor windows 2008 R2 y lo reinstalé, quedó igual aparentemente, además que existe un software que transfiere un paquete .rar de una máquina remota al FTP de alli lo descarga otra máquina, el problema esta en que ese archivo .rar antes lo pasaba completo es decir si pesaba 600kb actualmente no lo pasa completo por decirles algo, cuando uno lo baja del FTP pesa 450kb, se pierde información, y he revisado los servicios FTP y estan configurados correctamente, pero donde es que se queda esa parte de los datos... porque al transferir directamente ese archivo .rar de la máquina remota sin usar el FTP lo transfiere completo sin daños, quiere decir que no es el internet el problema o el proveedor, entónces es alli donde no sé que modificar en el server o que es lo que esta mal, los equipos firewall estan configurados correctamente porque ya hice pruebas con la maquina remota sin pasar por el FTP y el archivo .rar lo pasa completo, igual realicé pruebas pasando con el software un archivo mas pequeño y lo pasa completo, pero si sobrepasa los 600kb se pierden datos, al software no se le a modificado nada, alguna idea de que podría estar pasando?