Pues la verdad, depende del monitor. Los LCD a veces ni siquiera soportan otra frecuencia que no sea 60 Hz.
Los CRT deberían ir configurados lo más alto posible, 85 Hz si el monitor lo soporta. Esto es para hacer que el ojo reciba una imagen lo más "fija" posible, y evitar que capte los cambios entre pantalla y pantalla. Para mí es muy fácil notar cuando un monitor CRT está a 60Hz, y de hecho me provoca problemas a los pocos minutos (no solo en la vista, sino un principio de mareo).
Yo no creo que mi vista se haya dañado por usar un CRT (aunque la última vez que cambié mis anteojos me aumentaron el aumento, valga la rebuznancia), pero sí noto que los ojos me empiezan a molestar casi inmediatamente cuando estoy frente a un CRT sin los anteojos. Los LCD no me provocan el mismo efecto, por suerte.
Como se mencionó antes, nada mejor que prevenir con ejercicios frecuentes para la vista
Saludos.