te comento que yo tengo w2k y ie6 en la cuarta parte de maquina que tu, evidentemente tienes alguna aplicacion o servicio corriendo y consumiendote muchos recursos.
primero que todo pasale un buen antivirus actualizado. si tienes el antivirus corriendo prueba a desactivrle el scaneo constante. bajate el ad-aware de lavasoft y pasaselo a ver que te dice. quizas tengas un monton de inquilinos indeseables de tipo loop o cydoor.
si con todo esto no mejor tendras que desactivar algunos de los servicios de w2k. ya eso no se decirtelo de memoria pero supongo que en el sitio de macrosoft podras encontrar algo. no creo que esto ultimo sea necesario porque yo tengo corriendo unos cuantos servicios extras, como apache y mysql y no me dan problemas.
si haces todo eso y todavia no mejora puede que tengas algun problema de hard. temperatura por ejemplo. mira a ver a que temperatura esta el procesador. puede tambien deberse a un problema de memoria defectuosa o algo aasi pero creo que esto ultimo es menos probable.
bueno, intenta un poco y dime despues.