Claro pero el browser es una cosa y el sistema de archivos es otra cosa diferente, recuerda que PHP se ejecuta en el servidor, por lo que un path absoluto funciona bien.
Ejemplo en windows es perfectamente válido:
Código PHP:
Ver originalinclude('C:\archivos\php\comunes\header.php');
En unix el anteponer un slash / al inicio hace que te vayas a la raíz del sistema de archivos:
Código PHP:
Ver originalinclude('/var/www/archivos/comunes/header.php');
y eso no tiene nada que ver con el browser, cuando tu usas / al inicio, se refiere al DOCUMENT_ROOT de tu servidor web, pero no a la raíz del disco duro, por lo que un path como el de arriba debe de funcionar de manera absoluta, este el allow_url_include o no, ya que es una llamada al sistema de archivos local.
¿Estas plenamente seguro que usas tal cual ese código, o estas usando otro tipo de código para realizar el include?