El textarea originalmente va a probocar un \n (o \r o \n\r) para un sálto de línea .. no "HTML" con un tag <br> o similar (a no ser que uses un "textarea" RTF o similar que generes HTML en el fondo en ese textarea.
De todas formas .. si quieres quitar todo tag HTML de una cadena dada .. puedes usar:
strip_tags()
www.php.net/strip_tags
Sólo serán respetados los \n (saltos de línea) que tengas en tu HTML original .. Es decir .. si haces:
<b>hola mundo</b><br>
blabla
así lo veras tal cual en tu "texto plano" .. pero si haces:
<b>hola mundo</b><br>blabla
el "Hola mundo" con el "blabla" lo veras seguido (pese que en HTML interpretado veas el salto de línea).
Si quieres convertir los \n (originales de tu textarea) en <br> .. para enviar tu e-mail en formato HTML (con sus cabeceras HTTP adecuadas) .. usa:
nl2br()
www.php.net/nl2br
Un saludo,