Proteccion de directorios contra ataques??

[webAp]

quisiera saber si alguien tiene una formula o manera correcta que me pueda orientar para saber como proteger un sitio que realice contra el hackeo y mas bien contra el uso indebido de descargarlo con webcopier o httrack ,

gracias por leer, y muchas gracias de antemano por cualquier ayuda.
saludos

[Patriarka]

y solo tenes que dar todos los permisos a las carpetas que correspondan
por ej la upload de imagenes y validar que solo se guarden imagenes!

ademas usa el .htaccess