No me reconoce como directorio

[Legolas_Bilbao]

por que cuando intento recorrer los distintos niveles de un directorio si bajo al 2º nivel no me coge lsa carpetas como directorios sino simplemente como ficheros

Código PHP:

  $dir  = opendir('.');
        $j = 0;
        $z = 0;
        while(false !==($file = readdir($dir))){
        if($file != "." && $file != ".."){
            if(is_dir($file)){
                $array_dir[$j] = $file;
                $_dir = opendir($file);
                while(false !==($file2 = readdir($_dir)))
                    {
                        if($file2 !="." && $file2 !="..")
                        {
                                                
                            if(is_dir($file2))
                            {
                                print "$file2 <br>";
                                $array_dir[$j][$z] = $file2;
                                $z++;
                            }else {
                            print "es fichero $file2<br>";
                            }
                        }
                    }
                    closedir($_dir);
                $j++;
                }
            }
        } 
   

Gracias