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Hacer un analisis previo de una aplicación PHP

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Hacer un analisis previo de una aplicación PHP

Buenas,

Como a todo buen hijo de vecino, me gusta hacer las cosas como toca. Y para eso lo primero que hay que hacer antes de tocar un teclado para hacer una aplicación, es hacer un análisis previo con papel y boli (así me enseñaron en la escuela). Lo que pasa es que me resulta bastante difícil hacer un análisis de aplicaciones web. No se por qué pero me cuesta.

Alguién sabe de algún método o software que te ayude a hacer un buen análisis previo de aplicaciones PHP?

Algo estándard que se use para ello.

Muchas gracias.
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