Puedes hacerlo con PHP de esta manera
(fragmento tomado de php.net) Código PHP:
$numero = 1234.56;
// notacion inglesa (predeterminada)
$numero_formato_ingles = number_format($numero);
// 1,234
// notacion francesa
$numero_formato_frances = number_format($numero, 2, ',', ' ');
// 1 234,56
$numero = 1234.5678;
// notacion inglesa sin separador de miles
$numero_formato_ingles = number_format($numero, 2, '.', '');
// 1234.57
O bien con MySQL usando FORMAT(X,D), donde X es el numero a formatear y D la cantidad de decimales a mostar, por ejemplo:
SELECT FORMAT(5612332.1,3);
devolvera => 5,612,332.100
Salutes!