Hola,
hemos creado un vídeo en el que explicamos como conectar MongoDB en un proyecto Node.js. Lo hemos hecho a partir de un API muy sencillo que ya teníamos implementado con Express, y hemos publicado el código para que podáis usarlo.
Espero que os sirva.
https://www.youtube.com/watch?v=g0UYD4sXot4&feature=youtu.be