a mi me sucedía lo mismo hasta que comprendí que solo hay que usar DW como editor, para realizar cambios en el html o diseño, los mejor es usar filezilla, ¿como?
primero entras por FTP con los datos que todos conocemos y luego simplemente tomas el archivo que quieres trabajar, lo llevas a DW haces tu cambios y luego le das en guardar como, te mostrara una carpeta que previamente haz creado, que ves tambien en fillezille, luego le das ok, y finalmente arrastras el archivo a la carpeta del servidor te dira que ya existe un archivo con ese nombre , le das en sobrescribir y listo luego F5 y listo.....