Je je... Sí, el maldito Service Pack 2 hace eso con los Activex que se ejecutan localmente. Me parece que se puede desactivar esa proteción en las nuevas configuraciones de seguridad que instala SP2 en el Explorer, pero realmente yo no pude dar con la combinación adecuada de opciones. Por la "agradable" nueva barrita amarilla del Explorer y otras razones más, terminé sacando el SP2.
No te preocupes que al reproducir los flash desde un servidor, el mensaje de protección no aparece. Si quieres ver los flash localmente debes indicarle al Explorer que permita visualizar el contenido de la página haciendo click en la barrita amarilla, pero cada ves que cierres y vuelvas a abrir el Explorer aparecerá el mensaje nuevamente.