Después de leer mucho me he decidido a publicar mi problema a ver si me podeis ayudar.
Tenemos montado un servidor II6 con SQL Server 2000 y una serie de dominios.
Utilizamos una dll para mostrar ciertos resultados y tengo unos includes comunes que utilizan todos los dominios (15 mas o menos)
El mayor número de visitas se concentran los fines de semana.
Desde hace unos meses, estamos viendo que los sabados de 8 a 11 de la noche (habrá mas o menos 1000 visitas), las páginas del dominio mas importante dejan de funcionar

Siempre hemos tenido algun que otro problema, pasamos de iis5 a iis6 hace dos meses mas o menos, aumentamos la velocidad del servidor... ya no sabemos que mas probar.
Muchas gracias por vuestro tiempo.
Un saludo