Diccionarios...y empezando en python jeje

[theUniC]

Hola a todos,

Estoy realizando un script del cual mi mayor problema és el siguiente:

Tengo una serie de datos en un diccionario (llamémosle a) que contiene:

Código PHP:

    a = {'TTA':'Leu', 'TTT':'Phe'.........} 
   

#el diccionario contiene más datos pero para mi duda me vale solo con eso

si yo tengo un string de caracteres tal que:

Código PHP:

   cadena = ACTTTTACCTAGTTGACTA 
   

# és un ejemplo la cadena està inventada

como puedo recorrer el diccionario para sustituir las LETRAS EN MAYÚSCULA por las letras que no lo són, tal y como hace referencia el diccionario?????


El resultado final tendria que quedar de la siguiente manera:

Código PHP:

  cadena = ACTTTTACCTAGTTGACTA 
 
                         cadena_nueva = SerPheAlaMetValSer                 
 
#el diccionario contiene toda una serie de valores para poder sustituir cualquier combinación A,C,T y G de 3 letras. 
   

Llevo días buscando una solución al tema y no la encuentro, estaría muy agradecido si alguien me pudiera ayudar con los diccionarios

[razpeitia]

Dado que no tengo el diccionario con todos los valores:

Código python:

dic = {} #Aqui va el diccionario con todos los valores
def split_seq(seq, size):
    """ Divide una lista, en bloques del tamaño dado """
    return [seq[i:i+size] for i in range(0, len(seq), size)]
 
def translate(s, d):
    ns = ""
    for i in split_seq(s, 3):
        ns += d[i]
    return ns
 
cadena = "ACTTTTACCTAGTTGACT"
nueva_cadena = translate(cadena, dic)
 

[srmagno]

Otra solucion puede ser la siguiente:

def translateSeq(seq, cod):
""" retorna la secuencia convertida segun el codigo """
ns=""
while len(seq)>2:
try:
ns +=cod[seq[:3]]
except KeyError:
pass
seq = seq[3:]
return ns

[srmagno]

otra solucion puede ser la siguiente

Código PHP:

  def translateSeq(seq, cod):
       """ retorna la secuencia convertida segun el codigo """
       ns=""       
       while len(seq)>2:
         try:
             ns +=cod[seq[:3]]  
         except  KeyError:
           pass 
         seq = seq[3:]
       return ns 
   

Un saludo.