Hola amiga bueno para realizar esto utiliza este script.
Código:
<HTML>
<HEAD>
<TITLE></TITLE>
<script language="javascript">
<!--
function LP_remplazar(){
var data=abc.txtTextoBusqueda.value;
var dato1=data.substring(0,2)+'.';
var dato2=data.substring(2,4)+'.';
var dato3=data.substring(4,7);
var datarem=dato1+dato2+dato3;
abc.txtTextoBusqueda.value=datarem;
}
-->
</script>
</HEAD>
<BODY>
<form name=abc>
<input type=text name="txtTextoBusqueda" maxlength=6>
<input type=button value=Convertir onClick="LP_remplazar()">
</form>
</BODY>
</HTML>
como veras utiliza la propiedad substring del objeto string. ;)