Buenas he observado alguna web para ver como utilizar el confirm:
y los ejemplos q visto son con boton, es posible hacer esto, q haciendo un Script obtengamos en una variable el resultado de lo que el usuario elegida si acepta(true) si cancela(false), es posible usar esa variable luego en mi codigo java, desconozco javaScript pero no java, y no se si hay posibilidad de obtener la varible de alguna manera, ahi va mi ejemplo a ver si me pueden ayudar:
http://www.uv.es/jac/guia/jscript/javascr08.htm -->es la web donde encontre el confirm
<script>
var=confirm("El usuario ya existe ¿Desea modificarlo?");
</script>
<%
if(var==true){
out.println("True");
}
else if(var==false){
out.println("False");
}
else{
out.println("Nada");
}
%>