Hola, Vidondo. Bienvenido al Foro.
No se si he entendido bien tu duda
Si en el archivo .js tienes:
function multi(a,b) {
return a*b }
desde la página html la llamarías con:
<script>c=multi(5,3)</script>
Si no es esto lo que querías, vuelve a preguntar las veces que haga falta. Saludos,