Cuando haces clic en el campo text la función le quita los puntos al valor:
Código:
<html>
<head>
<script language="javascript" type="text/javascript">
function limpiar(elemento) {
var texto = elemento.value;
while (texto.indexOf('.') != -1)
texto = texto.replace('.','');
elemento.value = texto;
}
</script>
</head>
<body>
<input type="text" name="valor" id="valor" value="2.000.000" onclick="limpiar(this)" />
</body>
</html>