El problema es que intente con el siguiente código:
Código Javascript:
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window.open('reportesPHP/reporteHistorial.php?accion=excel&idGPS='+idGPS+'&velocidad='+velocidad+'&fechas='+fechas+'&direcciones='+direcciones+'');
Pero como la cantidad de datos puede ser excesiva me manda un error por exceder el limite de datos via GET, entonces no se si exista una manera de poder enviar los datos via POST con un window.open para poder generar el archivo excel en php.