por ejemplo si selecciono el primer checkbox solo me rellne en el primer array y asi sucesivamente
Código PHP:
....
Sistema 1<input type="checkbox" name="sistema_1[]" id="sistema_1" value="1" />
//este depende del sistema seleccionado, osea en este caso sistema_1
menu1<input type="checkbox" name="menu_1[]" id="menu_1" value="1" />
menu2<input type="checkbox" name="menu_1[]" id="menu_2" value="2" />
Sistema 2<input type="checkbox" name="sistema[]" id="sistema_2" value="2" />
//este depende del sistema seleccionado, osea en este caso sistema_2
menu1<input type="checkbox" name="menu_2[]" id="menu_1" value="1" />
menu2<input type="checkbox" name="menu_2[]" id="menu_2" value="2" />
....
//y al hacer click este valla rellenado el array una cosa asi:
array(array(1,array(1,2)), array(2,array(1,2)))
y al deschekear tambien k se vacie el array.